К моменту возвращения Маака в Иркутск генерал-губернатор Му­равьев готовил военно-топографи­ческую экспедицию, вошедшую в исто­рию под названием «Второй сплав по Амуру». Несмотря на более чем прохладное отношение правительства к освоению дальневосточных террито­рий, Муравьев планомерно присоеди­нял к России «ничейные» земли бас­сейна Амура, за что к его фамилии было добавлено Амурский.

В предыдущий год «первого спла­ва» Муравьевым был заключен с Китаем действующий и поныне «Айгунский договор». Он узаконил четкую границу между двумя государствами, которой не имелось до тех пор, и земли их «были без призора». По это­му договору к-России отходило все левобережье Амура, Уссурийский край и Сахалин, объявленные русскими владениями капитаном Г. И. Не­вельским в 1850 г. Но эти земли еще не были нанесены на карту и не опи­саны природоведами.

Амурским сплавом руководил астроном Л. Э. Шварц, а природо­ведом Сибирский отдел Географи­ческого общества назначил Маака. 6 апреля 1855 г., не успев обрабо­тать вилюйский материал, не отдох­нув, Маак, Зондгаген и Фурман са­дятся в лодки и вместе с ледоходом движутся вниз по течению Амура. При этом если военно-топографическая часть экспедиции существовала на государственные деньги, то географы финансировались еще не окрепшим Географическим обществом. Для этих целей золотопромышленник Соловьев пожертвовал полпуда золота.

В противоположность медлитель­ной Вилюйской экспедиции Амурский сплав быстро достиг крупных озер в низовье Амура. Записи Маака были беглыми. Однако при возвращении, когда лодки тащили вверх по тече­нию, исследователи шли пешком и вели подробные записи и сборы образцов.

Благодаря деньгам Соловьева кни­га Маака «Путешествие по Амуру» вышла в 1859 г., т. е. быстрее, чем труды Вилюйской экспедиции. Это бы­ло первое описание Приамурья, в ко­тором очень нуждались осваивавшие его    в    дальнейшем    исследователи.

Южнее нижнего течения Амура простирался необжитый и совер­шенно неисследованный Уссурийский край. В 1859 г. было решено постро­ить у озера Ханка первый военный русский пост. И тут понадобилось срочное географическое описание. 26 апреля Маак снова выезжает из Иркутска и доплывает по Амуру до устья реки Уссури. Эта экспедиция обследовала всю долину Уссури, приустьевые ее притоки и пред­горья Сихотэ-Алиня. К 28 августа 1859 г. она достигла военного поста на Ханке.

Не выдержав чрезмерного напря­жения, Маак серьезно заболел, и даль­нейшее   исследование   прекратилось.

В Иркутск он смог возвратиться только зимой, а в марте 1860 г., уже в Петербурге, приступил к обра­ботке экспедиционных материалов. Труды Уссурийской экспедиции были изданы в 1861 г.

В 1865 году Маака назначили ди­ректором школ Иркутской губернии. По его инициативе впервые в Восточ­ной Сибири был созван учительский съезд. В результате появилась еди­ная методика обучения в приходских школах. Съезд установил почти обя­зательное для учителей природоведе­ние   Сибири.   Это   послужило   широкому развитию краеведения, появле­нию многочисленных статей в газетах и журналах, выпуску отдельных бро­шюр по географии Восточной Сибири. После съезда заметен стал значи­тельный подъем образования и общей культуры огромного края восточнее Енисея. Иркутск все основательнее становился крупным культурным центром Сибири.

Умер Маак в 1886 г. в Петер­бурге, уже будучи на пенсии. Но до самой кончины был членом совета министерства народного образова­ния.